Guerra, espionaje y religión está atravesada por una investigación realizada por Godofredo Alejandro de Vega Reyes acerca del protestantismo y su entrada en Cuba en un recorrido que abarca desde la colonia hasta los primeros años de la Revolución Cubana. «El libro no pretende ser la historia de las iglesias evangélicas, sino de sus interrelaciones con hechos relevantes de nuestra historia», como expresa el autor en el prólogo.